Der junge Student Narumi Takayuki ist im drittem High School Jahr. Seine Klassenkameraden Mitsuki und Shinji sind bereits fleissig am Lernen für die Aufnahmeprüfung an der Universität, im Gegensatz zu Takayuki. Die junge und schüchterne Haruka hat sich in Takayuki verliebt und durch ihre beste Freundin Mitsuki kann sie ihm auch ihre Liebe gestehen. Die Beziehung zwischen den beiden läuft am Anfang jedoch nicht ganz so gut, da es so scheint als wäre Takayuki nicht wirklich in sie verliebt, jedoch mit der Zeit ändert sich seine Einstellung und er verliebt sich richtig in sie. In der ersten Nacht, die sie zusammen verbringen, leisten sie einen Schwur. Jedoch, wie es kommen musste, währt dieses Glück nicht lange. Dadurch, dass Takayuki von Mitsuki, an ihrem Geburtstag, aufgehalten wird und sich dabei von ihr überreden lässt, ihr einen Ring als Geburtstagsgeschenk zu kaufen, kommt dieser zu spät zu seinem Date mit Haruka. Kurz nachdem er mit Verspätung am Treffpunkt ankommt, bemerkt er wie sich eine Menschenmenge und ein Rettungswagen in der Nähe, wo er sich mit Haruka treffen wollte, befindet. Takayuki sieht eine Blutlache auf dem Boden und die unverkennbare rosa Schleife, welche Haruka meistens in ihrem Haar trägt. Erst jedoch nachdem der anwesende Polizist durch sein Handy den Unfall meldet und dabei den Namen Suzumiya Haruka erwähnt, ist es Eindeutig, dass die Blutlache und die Schleife von Haruka sind, welche durch einen Autounfall ins Koma gefallen ist. Dies ist ein harter Schlag für Takayuki, sodass er in eine schwere Depression fällt. Er fühlt sich schuldig, daer glaubt, durch seine Verspätung am Unfall von Haruka Schuld zu sein. Mitsuki bemerkt, wie sich Takayuki immer mehr von der Außenwelt abkapselt und sich nicht mehr wirklich um sich selber kümmert. So beschliesst sie, sich um ihn zu kümmern. Dabei kann sie ihre Gefühle, die sie für ihn hat, nicht mehr länger unterdrücken und gesteht ihm ihre Liebe.
Drei Jahre später wacht Haruka aus ihrem Koma auf und weiß nicht, dass bereits drei Jahre vergangen sind. Sie leidet unter einen Art Amnesie, weswegen die behandelnde Ärztin wünscht, diese vergangene Zeit vor Haruka nicht zu erwähnen. Sie möchte damit die zerbrechliche Psyche von Haruka schützen, um zu verhindern, dass sie erneut ins Koma fällt. Da für Haruka keine Zeit vergangen ist, und sie Takayuki noch immer liebt, gerät Takayuki in einen Konflikt seiner Gefühle und Empfindungen zwischen Mitsuki und Haruka